কোনো নলকূপের পাম্প স্থাপন কালে পাম্পের অ্যালাইনমেন্ট ঠিক রাখা খুবই জরুরি একটা বিষয়। প্রাইম মুভার অর্থাৎ ইঞ্জিন বা মোটরের শ্যাফটের অক্ষের সাথে একই অক্ষে পাম্প বসানোকেই পাম্পের অ্যালাইনমেন্ট বলা হয়। পাম্পের অ্যালাইনমেন্ট ঠিক রাখার জন্য পাম্প স্থাপন কালে লেভেলিং যন্ত্রের সাহায্যে পাম্পের অ্যালাইনমেন্ট সঠিকভাবে নির্ধারণ করতে হবে। নির্ধারিত এই অ্যালাইনমেন্ট মোতাবেক পাম্পের বেল বা ফাউন্ডেশন তৈরি করতে হবে। এ ছাড়া স্থাপনকালে চূড়ান্তভাবে অ্যালাইনমেন্ট মেপে সেই মোতাবেক পাম্প বেজের নাট-বোল্টের মাঝে প্রয়োজন বোধে ওরাপার বা ধাতব প্যাকিং দিতে হবে। এ ভাবে সঠিক অ্যালাইনমেন্টে পাম্প স্থাপন করতে হবে।
নলকূপের পাম্প যদি তার প্রাইম মুভারের সাথে একই অ্যালাইনমেন্টে না বসানো হয়, তাহলে পাম্প চালানোয় নানা ধরনের অসুবিধা দেখা দিতে পারে। যেমন-
১) পাম্প পূর্ণ গতিতে ঘুরবে না ।
২) ইঞ্জিন বা মোটরের অতিরিক্ত শক্তি ব্যয় হবে।
৩) অতিরিক্ত তেল জ্বালানি খরচ হবে।
৪) বিয়ারিং তাড়াতাড়ি ক্ষয়প্রাপ্ত হবে
৫) রক্ষণাবেক্ষণ খরচ বেড়ে যাবে।
৬) পানি কম উঠবে।